في سياق المرحلة الثانية من عملية دانتي وبعدما استولت الوحدات الإسرائيلية على اللد والرملة وهجرت سكانهما اندفعت بعض الوحدات شرقاً باتجاه اللطرون. ومن المرجح ان تكون خربة البويرة احتلت اثناء هذا الاندفاع أواسط يوليو/تموز 1948.